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Junio es el mes de transición entre la primera temporada de precipitaciones y la segunda temporada de menos lluvias del año. En algunas áreas de las regiones cafeteras Central y Sur, se estiman disminuciones de la precipitación, entre el 20% y 40%, con respecto a los promedios. Para el resto del área, se esperan valores cercanos a la climatología de referencia 1991-2020. Actualmente el Océano Pacífico está en condición Neutra, pero algunos cambios en las variables oceánicas y atmosféricas son consistentes para que en el futuro se desarrolle una condición El Niño.