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First insights into the gut microbiome of Diatraea saccharalis: From a sugarcane pest to a reservoir of new bacteria with biotechnological potential First insights into the gut microbiome of Diatraea saccharalis: From a sugarcane pest to a reservoir of new bacteria with biotechnological potential


DOI

Palabras clave
Colombia

Diatraea saccharalis

Biocatalizadores y bioprocesos

Biodiversidad

Microbioma

Caña de azúcar

Sección
Artículos
Términos de licencia (Ver)
Creative Commons License

Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0.

Edinson Puentes Cala
María Atehortúa Bueno
Valentina Tapia Perdomo
Lucio Navarro Escalante
Jorge Hernández Torres
Genis Castillo Villamizar

Resumen

La biodiversidad de un país es un recurso clave para el desarrollo de una bioeconomía sostenible. Sin embargo, con frecuencia los países más biodiversos del planeta apenas obtienen beneficios de su diversidad biológica. Por el contrario, en ocasiones algunos componentes de esa biodiversidad se convierten en una amenaza para la sociedad y para la sostenibilidad alimentaria. Ese es el caso del barrenador de la caña de azúcar, Diatraea saccharalis. En este estudio, el análisis de las bacterias asociadas al tracto digestivo de D. saccharalis reveló una microbiota rica y diversa. Se analizaron dos tipos de dietas bajo condiciones de laboratorio. El análisis metataxonómico reveló varios taxones comunes en la mayoría de los grupos larvales analizados, con abundancias relativas superiores al 5 %, así como cinco familias de bacterias que también han sido reportadas en el intestino de otro lepidóptero. Una gran fracción de los microorganismos detectados mediante secuenciación de amplicones fue considerada rara y difícil de cultivar. Sin embargo, entre los microorganismos cultivables se identificaron 12 cepas con características biotecnológicas relevantes. La cepa que mostró la mayor actividad celulolítica (GCEP-101) fue secuenciada genómicamente. El análisis del genoma completo de GCEP-101 reveló que los valores de identidad del ARNr 16S, el Índice de Nucleótidos Promedio (ANI, por sus siglas en inglés) y la hibridación ADN-ADN digital ubican a la cepa como candidata a una nueva especie dentro del género Pseudomonas. Además, la anotación genómica de esta posible nueva especie evidenció la presencia de genes asociados con la degradación de la celulosa, revelando el potencial oculto de esta plaga como reservorio de microorganismos biotecnológicamente relevantes.

Citación APA 7ed:

Puentes-Cala, E., Atehortúa-Bueno, M., Tapia-Perdomo, V., Navarro-Escalante, L., Hernández-Torres, J., & Castillo-Villamizar, G. (2023). First insights into the gut microbiome of Diatraea saccharalis: From a sugarcane pest to a reservoir of new bacteria with biotechnological potential. Frontiers in Ecology and Evolution, 11, 1027527. https://doi.org/10.3389/fevo.2023.1027527

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