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A coffee berry borer (Hypothenemus hampei) genome assembly reveals a reduced chemosensory receptor gene repertoire and male-specific genome sequences A coffee berry borer (Hypothenemus hampei) genome assembly reveals a reduced chemosensory receptor gene repertoire and male-specific genome sequences


DOI

Palabras clave
Broca del café

Biología de la broca

Genoma

Hypothenemus hampei

Sección
Artículos
Lucio Navarro
Erick Hernandez-Hernandez
Jonathan Nuñez
Flor Acevedo
Alejandro Berrio
Luis Miguel Constantino
Beatriz Padilla Hurtado
Diana María Molina
Carmenza Esther Góngora
Jeff Stuart
Pablo Benavides

Resumen

La broca del café (Hypothenemus hampei) es una plaga de importancia económica mundial del café (Coffea spp.). A pesar de los actuales métodos de control de insectos para controlar la broca, el desarrollo de futuras estrategias de control requiere una mejor comprensión de su biología y la interacción con su planta huésped. Con este objetivo, realizamos de novo la secuenciación del genoma y el transcriptoma de la broca, mejoramos el ensamblaje del genoma de la broca y predecimos 18.765 genes codificadores de proteínas. Utilizando los datos del genoma y del transcriptoma, se anotaron los genes asociados con la quimiosensación y se encontró un repertorio reducido de genes compuesto por 67 receptores odorantes (ORs), 62 receptores gustativos (GRs), 33 receptores ionotrópicos (IRs) y 29 proteínas de unión a odorantes (OBPs). El análisis in silico de la abundancia de transcripción de estos genes quimiosensoriales reveló un enriquecimiento de la expresión en los adultos de broca en comparación con las larvas. La detección de genes quimiosensoriales expresados diferencialmente entre machos y hembras está probablemente asociada a diferencias en el comportamiento de búsqueda de hospedadores entre sexos. Además, descubrimos el contenido genómico específico de los machos e identificamos genes candidatos expresados específicamente por los machos en estos andamiajes, lo que sugiere que un cromosoma de tipo Y puede estar implicado en el mecanismo funcional haplodiploide de determinación del sexo de la broca del café.

Lucio Navarro, Centro Nacional de Investigaciones de Café

Investigador Científico I, Disciplina de Entomología. Cenicafé


Luis Miguel Constantino, Centro Nacional de Investigaciones de Café

Investigador Científico II, Disciplina de Entomología. Cenicafé


Diana María Molina, Centro Nacional de Investigaciones de Café

Investigador Científico I, Disciplina de Mejoramiento Genético. Cenicafé


Carmenza Esther Góngora, Centro Nacional de Investigaciones de Café

Investigador Científico III, Disciplina de Entomología. Cenicafé


Pablo Benavides, Centro Nacional de Investigaciones de Café

Investigador Científico III, Disciplina de Entomología. Cenicafé


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