Functional Characterization of Native Microorganisms from the Pulp of Coffea arabica L. Var. Castillo and Cenicafé 1 for Postharvest Applications and Compost Enhancement Functional Characterization of Native Microorganisms from the Pulp of Coffea arabica L. Var. Castillo and Cenicafé 1 for Postharvest Applications and Compost Enhancement

La pulpa de café, el principal residuo generado durante el beneficio húmedo de Coffea arabica L., se aplica con frecuencia directamente a los campos como una enmienda orgánica cruda del suelo. Sin embargo, esta práctica a menudo carece de una estabilización microbiana adecuada, lo que limita su potencial agronómico y plantea riesgos debido a la presencia de compuestos fitotóxicos. En Colombia, variedades resistentes a enfermedades como Coffea arabica L. var. Castillo y var. Cenicafé 1, desarrolladas por el Centro Nacional de Investigaciones de Café (Cenicafé), se encuentran entre las más cultivadas en el país; no obstante, a pesar de su amplia adopción, la ecología microbiana de los residuos poscosecha de estas variedades sigue estando poco caracterizada. Este estudio tuvo como objetivo aislar y caracterizar funcionalmente comunidades microbianas nativas de la pulpa de Coffea arabica var. Castillo y var. Cenicafé 1, y evaluar su papel en el procesamiento poscosecha y en la gestión de residuos orgánicos. Se recolectaron muestras frescas de pulpa en una planta de beneficio húmedo ubicada en zonas tropicales de media altitud. Se recuperó un total de 53 aislados microbianos mediante técnicas dependientes de cultivo en medios selectivos dirigidos a levaduras, bacterias ácido lácticas (BAL) y hongos filamentosos. La secuenciación de amplicones del gen 16S rRNA (región V3–V4) y de la región ITS1 se llevó a cabo para perfilar las comunidades bacterianas y fúngicas, revelando consorcios microbianos diversos dominados por especies de Aspergillus, Lactobacillus, Leuconostoc, Pichia y Saccharomyces. Los ensayos enzimáticos indicaron una alta actividad pectinolítica y celulolítica. Los ensayos de compostaje con pulpa inoculada mostraron una reducción de ~40% en el tiempo de compostaje y una mejora en el contenido de nutrientes. Estos hallazgos respaldan el uso de la microbiota nativa para mejorar la eficiencia del compostaje y la valorización poscosecha, contribuyendo a sistemas cafeteros más sostenibles y circulares.

Citación:  Figueroa-Varela, P. A., & Duque-Dussán, E. (2025). Functional Characterization of Native Microorganisms from the Pulp of Coffea arabica L. Var. Castillo and Cenicafé 1 for Postharvest Applications and Compost Enhancement. Applied Microbiology, 5(3), 86. https://doi.org/10.3390/applmicrobiol5030086