El manejo del árbol depende de la fisiologÃa del cultivo asociado y sus necesidades microclimáticas, la fenologÃa de la especie de sombra, el clima y suelo local, las caracterÃsticas de crecimiento del árbol de sombra y su tolerancia a podas, asà como las percepciones de los agricultores sobre las diferentes especies de sombra y cultivos asociados.