Exploring the soil-associated bacterial microbiome of coffee plantations in different regions of Colombia: a metabarcoding approach

Lorena Jacqueline Gómez-Godínez; Víctor Ochoa; Valeria Faggioli; Marco Aurelio Cristancho

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Exploring the soil-associated bacterial microbiome of coffee plantations in different regions of Colombia: a metabarcoding approach Exploring the soil-associated bacterial microbiome of coffee plantations in different regions of Colombia: a metabarcoding approach

VINCULO

Publicado: 7 Marzo 2024

DOI

Palabras clave

Metabarcodificación

café

especies bacterianas no cultivadas

Número

Publicaciones externas 2024

Sección

Artículos

Lorena Jacqueline Gómez-Godínez

Víctor Ochoa

Valeria Faggioli

Marco Aurelio Cristancho

https://orcid.org/0000-0001-9115-4117

Resumen

Journal Rank: Q3 (Agricultural and Biological Sciences)

El café es uno de los principales cultivos tropicales producidos en el mundo. Colombia ocupa el tercer lugar en la producción mundial de café. Los microorganismos asociados a las plantas de café pueden tener muchas aplicaciones biotecnológicas, como la promoción del crecimiento de las plantas y el control biológico. Objetivo: Describir las bacterias presentes en el suelo asociadas al cultivo de café. Para ello se utilizó un enfoque de secuenciación masiva o metabarcodificación del ARNr 16S. A través de los resultados obtenidos, se concluye que los estudios realizados mediante metabarcodificación ayudan a conocer la composición de los microorganismos asociados al café y, con ello, tratar de dilucidar las funciones de los microorganismos asociados.

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